Fontos, hogy néha az egyik adónem tekintetében megoldást jelentő módszer egy másik adónem esetében kockázatot indukálhat, vagyis az ilyen összefüggéseket célszerű még az ellenőrök érkezése előtt nagyon alaposan megvizsgálni. Ilyen tényező lehet a transzferár korrekciók egyösszegű visszaszámlázása, a kapcsolt felek közötti ingyenes ügyletek ellenértékessé tétele, a végleges pénzeszközátadás kiszámlázása, a teljesítés nélküli kiszámlázások, árengedmények, visszáruk visszaszámlázása, továbbá ha az utólagos árengedményt nem kíséri számlakorrekció. Áfa esetében pedig például a fiktív számla miatti jogosulatlan áfa levonás társasági adóban nem elismert ráfordításként jelentkezhet.
Az észlelt hiányosságokat, hibákat szükség esetén önellenőrzéssel lehet módosítani, 2012-től pedig egy új jogintézmény is segítséget nyújt. Ha az adózó nem biztos benne, hogy a bevalláskor jól értelmezi a jogszabályokat, ezt a bizonytalan adójogi helyzetet bejelentheti az adóhatósághoz – mindez megfelelő szakértői indoklással alátámasztva felmentést adhat a későbbi esetleges szankciók (adóbírság, mulasztási bírság) alól.
Transzferár dokumentáció
A transzferár nyilvántartás vagy transzferár dokumentáció a transzferár nyilvántartási kötelezettségek legismertebb része, melynek további, ám kevésbé használt elnevezése a transzferár szabályzat, jóllehet a hétköznapi értelembe vett szabályzatokhoz nincs köze. A transzferár nyilvántartási kötelezettség elsődleges célja annak alátámasztása, hogy az adott üzleti évben a kapcsolt vállalati tranzakciók a szokásos piaci ár elvével összhangban köttettek.
A transzferár nyilvántartás / transzferár dokumentáció az általános hozzáállással szemben sokkal inkább lehetőség, mint teher, hiszen az adózó saját maga mutathatja be mindazon körülményeket és tényeket, amik az egyes tranzakciókkal összefüggenek. Ezzel összhangban, a nyilvántartás egyik alfejezetének elkészítése sem tekinthető pusztán adminisztratív feladatnak, ugyanis ideális esetben az összes fejezet fontos a maga szempontjából, és a megfelelően felépített alfejezetek együttesen, egymásra épülve alkotják azt a hatékony nyilvántartást, mellyel az adózó a lehető legalacsonyabb szintre tudja csökkenteni a kockázatait, és képviselni álláspontját.
A fentiekből következik, hogy a transzferár nyilvántartás / transzferár dokumentáció elkészítésének legfontosabb indoka az alkalmazott szerződési feltételek védelme, és csak részben az adminisztratív követelményeknek való megfelelés. Ez a nyilvántartások elkészítésénél az elsődleges szakmai szempont.